大结局里是药老规定萧炎杀掉自己的。药老当时为了逃离魂殿跟他们做了买卖，同意做魂殿的谋士，替魂殿效命。获得自由的药老躲到纳戒里逃避追捕，碰到萧炎后便把希望寄托于这个少年身上。可是药老的分身却还在魂殿为虎作伥，萧炎得知药老的真相后，惊恐万状。不愿被魂殿操纵来危害大陆药老规定萧炎杀掉自己。萧炎尽管极其舍不得，但为了斗气大陆的平静，只能含着泪杀掉自己的老师，摧毁了他的所有分身。

大结局为什么萧炎杀药老
药尘原为远古八族之一药族的后裔，由于受斗帝血脉较稀，在出任务失败之后被药万归赶出药族（《药老传奇》中是因药锋诬陷而被赶出药族），心里已完全与药族脱离关系。以后通过自己的努力，搞出中州第一炼药师的名头，且实力达到九转斗尊顶峰，因炼药师的身份交友许多。萧炎眼里药老年轻时情债也比较多，如丹塔三巨头之一的玄衣、花宗太上长老青仙女等（《药老传奇》中向花宗宗主花玉）。